Ничего себе вопросик! Пожалуй, он тянет на целую диссертацию .
Но постараюсь изложить лично свое мнение в общих чертах.

В последние годы многие дрессировщики очень часто спекулируют понятием "бесконфликтная дрессировка". Лично мое давно и глубоко сложившееся мнение - таковой не существует. Конфликт есть всегда. Если вы поставили себе задачу свести к минимуму "разборки" с вашей собакой, будь то разборки в бытовом плане или же в процессе спортивной подготовки, в первую очередь, вам нужно понять инстинкты и процессы жизнедеятельности животного, с которым вы живете и работаете.

Начнем с "бытовухи". Подрастающий щенок должен четко осознавать свою иерархическую ступень. При четком соблюдении правил и законов стаи ваш конфликт будет сведен к минимуму, но его не избежать, ибо генетически в каждом молодом животном заложена "возрастная программа". Переводя на человеческий язык, это выглядит так: "да, сегодня ты сильный, сегодня ты добываешь еду, сегодня ты меня наказываешь, сегодня ты меня обучаешь, и это значит - ты старше меня, а ЭТО значит - ты раньше меня состаришься, станешь слабее, и вот тогда я попробую занять твое место или хотя бы я не буду тебе подчиняться." Общаясь на протяжении многих лет с разными породами собак и их владельцами, две избитые фразы стали постулатами моей жизни: "Жажда первенства рождается вместе с мужчиной (жажда первенства живет в каждом животном)" и вторая: "Что наша жизнь? - Игра." Лишь играя на потребностях животного, на его психологических установках мы можем свести к минимуму конфликтные ситуации в разных сферах взаимоотношений. Если приводить пример на элементах спортивной дрессировки, самым ярким может быть упражнение на выработку команды "лежать". Лежачее положение для собаки является позицией подчинения, она очень дисциплинирует своенравных животных. Хорошо выработанная команда "лежать" и выдержка в этом положении сама по себе решает очень много иерархических вопросов.  В сети очень много информации в том числе и видео о том, как обучить собаку этой команде, этому положению, не применяя механического воздействия. Классический вариант: при помощи лакомства обучаем собаку принимать нужное нам положение (при правильной моторике движений это возможно даже без механических воздействий на собаку), затем демонстрируя собаке мячик или другой игровой предмет (мотивационный предмет, далее - -м.о.), мы подаем собаке команду на укладку... Скорее всего ваша собака не выполнит эту команду и в лучшем варианте вы ей просто не дадите мячик, продолжите игру и в подходящий момент попробуйте подать команду еще раз. Процентов 70 собак и со второй попытки не выполнит вашу команду, а вы продолжите ваши действия снова. После того, как собака все таки выполнит ваше требование, вы вознаградите ее м.о. и будете пребывать в счастливом осознании того, что добились от собаки выполнения упражнения БЕСКОНФЛИКТНО. Но, разве шантаж не является конфликтом?  Все ваши действия говорили следующее: пока ты не ляжешь, я не дам тебе м.о. Разве это не конфликт? Имея в распоряжении собаку с невысокой степенью доминанты вы можете рассчитывать на успех, но если вам попалось по-настоящему жесткое, доминантное животное - на вашем теле может прибавиться несколько новых шрамов, по тому как на шантаж сильное животное ответит агрессией.
И так можно разбирать любой метод "бесконфликтной дрессировки", по этому, для более подробного ответа на ваш вопрос требуется максимально подробное описание ваших проблем.

Н.Д.Криволапчук "Прикладная психология собаки"

Вера Сысоева
Ой, это я некорректно ответила.
Я имела в виду не то, что выше приведена цитата из этой книги.
Я порекомендовала эту книгу для прочтения.
Мне с моим распространённых проблем и конфликтов удалось избежать во многом благодаря этой книге. У автора есть и другие, написанные более простым языком, популярные, скажем так.  А "Прикладная психология собаки" больше предназначена для специалистов.
Вообще Наталья Дмитриевна Криволапчук - известный зоопсихолог, живёт и работает в Петербурге. Однако, её взгляды на распространённые проблемы поведения, способы их устранения, на мотивацию собаки, дрессировку и т.п. в некоторых принципиальных моментах резко расходятся с общераспространённым, скажем так, укоренившимся, с среде кинологов, инструкторов и т.д. мнением.

А вот ещё одна великолепная кинологическая библиотека http://sites.google.com/site/epaperru/

Вы знаете о ней ходят мнения разные...
Вот почитайте обсуждение зоопсихологии http://vkontakte.ru/board1235213#/topic-1235213_1559529 там люди упоминают о Натальи Дмитриевне.
По поводу ссылок, пожалуйста